Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMTC2Q8N394 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms