Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEST3Q8N1M1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms