Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10Q8N0Z9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10Q8N0Z9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms