Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC83Q8IWF9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC83Q8IWF9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms