Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37DQ86XT2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37DQ86XT2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms