Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms