Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HS2ST1Q7LGA3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HS2ST1Q7LGA3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms