Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PREX2Q70Z35 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms