Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
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