Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAPN12Q6ZSI9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms