Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
WDR88Q6ZMY6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WDR88Q6ZMY6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms