Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTE2Q6XPS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPTE2Q6XPS3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms