Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms