Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RWDD4Q6NW29 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms