Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms