Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms