Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM78BQ5VT40 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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