Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms