Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A3Q5K4L6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A3Q5K4L6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms