Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMER1Q5JTC6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms