Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PAN3Q58A45 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAN3Q58A45 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms