Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf17Q53FE4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms