Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC96Q2M329 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms