Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC27Q2M243 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms