Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RRN3P1Q2M238 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RRN3P1Q2M238 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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