Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPROQ16827 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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