Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCK2Q16822 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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