Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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