Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC85BQ15834 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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