Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms