Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIP13Q15645 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP13Q15645 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP13Q15645 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP13Q15645 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIP13Q15645 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms