Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKIV2LQ15477 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms