Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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