Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD3Q15054 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD3Q15054 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms