Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAM2Q15035 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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