Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNIP1Q15025 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms