Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCLAFQ15004 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCLAFQ15004 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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