Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFTN1Q14699 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms