Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE1CQ14123 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE1CQ14123 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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