Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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CNGB1Q14028 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB1Q14028 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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