Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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