Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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