Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SHROOM2Q13796 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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SHROOM2Q13796 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHROOM2Q13796 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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