Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LAMB3Q13751 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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