Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PEX6Q13608 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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