Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PICALMQ13492 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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