Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TOP3AQ13472 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TOP3AQ13472 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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