Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLAMF1Q13291 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLAMF1Q13291 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms