Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL28Q13084 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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