Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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